地狱入侵天堂，守护彩虹桥的主角被同伴打下人间。为了保命，主角牺牲神格以求自保，但不幸丧失记忆后坠入废墟。末日军团分团长泰兰迪克在一次执行任务时发现了废墟中的主角并将其救起。为了报恩，主角加入到了末日军团并跟随泰兰迪克深入地狱寻找人类与恶魔之间的真相。
进入地狱后泰兰迪克离奇失踪，并在贝雅特丽齐的帮助下进入了泰兰迪克的梦境。可惜贝雅特丽齐只能让主角进入梦境却不能真实见到其人，而泰兰迪克此时在哪也不得而知。在梦境与判官米诺斯的对战中，泰兰迪克身负重伤并已无力回天。在得知泰兰迪克不幸消息后，老兵撒肯将泰兰迪克临行前给予他保管的勋章托付给了主角，帮让主角带领军团冲出地狱。
在地狱的对战中，主角发现了地狱魔盒并且得知与自己的记忆关系密切。当进入地狱中途，主角见到了昔日推下天堂的“伙伴”后，在刺激下记忆开始苏醒。主角回忆起了部分记忆。并确立了一个重要的目标点——冲出地狱。
而后在离开地狱的突围战中，主角带领着泰兰迪克生前的部下一路奋勇高歌，最终利用地狱魔盒重新打开了地狱之门。
但进入地狱之门后，发现外界竟然已经变成了另外一个世界。这里被怪物们曾为炼狱，只有通过炼狱才可以进入人间。
带着疲惫的身体，主角依旧前行，最终在走出炼狱后，他们惊奇的发现，原来背叛末日军团的人正是泰兰迪克!他并没有死，甚至是以另外一个形态欺骗了主角。主角非常的愤怒，并带着复仇的心态将泰兰迪克斩杀。直至最后告破了末日军团与地狱王军的黑暗交易。因为需要更强大的力量，在地狱中，恶灵的力量与活人肉体相遇将会产生极大的威力。而泰兰迪克就是看中了这个，将自己也变成了一个挂着人皮的恶魔!
但天知道，他曾经拯救的主角竟然是守护彩虹桥的使者。而在将泰兰迪克击杀后，所有的记忆全部打开。而一路随行的贝雅特丽齐以及在炼狱入口出现的神秘人维吉尔的秘密也都真相大白。
主角最终走上了一条复仇的路线，在彩虹桥上恢复了自己的天神神力，并顺利升入天堂，但因为维吉尔和贝雅特丽齐已经是堕落后的天神，他们永远也无法回到天堂。在短暂的惜别后，主角完全不知道，在天堂之中，一个更令人血腥并令人厌恶的更大交易还在继续!
天堂之所以被恶魔如此轻易的入侵，其间最为惊人的秘密就在于天之殿堂的领袖，众神的王者宙斯。因为害怕他的兄弟们叛乱，因此允许以大量牺牲性命的方式妄图在混战之中除去那些肉刺。而他的兄弟魔王路西法仅仅只是一个诱饵，真正的谜底至今作者都不得而知……
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